一、猪场不同地区进行消毒
1、猪场大门口消毒。在猪场的大门口消毒池和各栋猪舍门口的消毒脚盆，可使用1：800氯制剂消毒液溶液，用以消毒来往人员的鞋和进出车辆的车轮，池内的消毒液每周更换2-3次。大门设喷雾消毒装置，对来往车辆的车身、车底盘进行细致、彻底的喷洒消毒。猪场大门口应设立洗手池。
2、猪舍消毒。每批猪只调出后要彻底清扫干净，用高压水枪冲洗，然后进行喷雾消毒或熏蒸消毒。据试验，采用清扫方法，可以使猪舍内的细菌减少21.5%如果清扫后再用清水冲洗，则猪舍内细菌数即可减少54%～60%。
3、环境消毒。猪舍周围环境每2～3周用2%火碱消毒或撒生石灰一次，场周围及场内污水池、排粪坑、下水道出口，每月用漂白粉消毒一次。在大门口猪舍人口设消毒池，使用2%火碱或5%来苏儿溶液，注意定期更换消毒液。每隔1～2周，用2%～3%火碱溶液（氢氧化钠）喷洒消毒道路；用2%～3%火碱，或3%～5%的甲醛或0.5%的过氧乙酸喷洒消毒场地。被病猪的排泄物和分泌物污染的地面土壤，可用 5%～10%漂白粉溶液、百毒杀或10%氢氧化钠溶液消毒。停放过芽孢所致传染病（如炭疽、气肿疽等）病畜尸体的场所，或者是此种病畜倒毙的地方，应严格加以消毒，首先用10%～20%漂白粉乳剂或5%～10%优氯净喷洒地面，然后将表层土壤掘起30厘米左右，撒上干漂白粉并与土混合，将此表土运出掩埋。在运输时应用不漏土的车以免沿途漏撒，如无条件将表土运出，则应加大漂白粉的用量（1平方米面积加漂白粉5千克），将漂白粉与土混合，加水湿润后原地压平。
4、车辆消毒。工作人员先打扫车辆，包括车表面和车内部，车辆内部包括车厢内地面、内壁及分隔板，外部包括车身、车轮、轮箍、轮框、挡泥板及底盘。除去车体大部分的污染物如泥土、稻草等。将可以卸载的，现场不能或不易消毒的物品移出放于场外。打扫完毕后，用高压水冲洗车辆表面、内部及车底，检查车辆看是否还有遗留的有机物。确定无残余有机物后将车辆驶入大门消毒池内。
使用消毒剂对车辆进行喷洒，特别注意工作人员卸载物品可能接触的地方，注意缝隙、车轮和车底。驾驶室由本场消毒人员喷洒消毒。驾驶员穿上消毒服及靴子并进行消毒后进入车辆驾驶室。消毒剂停留至少15-30分钟后驶出消毒间。若选用的消毒剂对车身有损伤的则用水冲洗完毕后再驶出。
二、根据猪场不同生产环节进行消毒
每周2次常规带猪喷雾消毒；流产、返情母猪：使用消毒剂对母猪体表、胎衣接触的5米范围内喷雾消毒。配种、采精前后用消毒剂对母猪后驱、阴户、公猪下腹部、包皮清洗消毒，并洗采精台、浸泡采精器具。
三、根据不同的目的进行消毒
1、猪舍的预防消毒。在一般情况下，猪舍应每年进行两次（春秋各一次）预防消毒。在进行猪舍预防消毒的同时，凡是猪停留过的处所都需进行消毒。在采取“全进全出”管理方法的机械化养猪场，应在每次全出后进行消毒。产房的消毒在产仔结束后再进行一次。猪舍的预防消毒，也可用气体熏蒸消毒，所用药品是福尔马林和高锰酸钾。
方法是按照猪舍面积计算所需用的药品量。一般每立方米空间，用福尔马林25毫升，水12.5毫升，高锰酸钾25克。计算好用量以后将水与福尔马林混合。猪舍的室温不应低于正常的室温（8℃～15℃）。将猪舍门窗紧闭。其后将高锰酸钾倒入，用木棒搅拌，经几秒钟即见有浅蓝色刺激眼鼻的气体蒸发出来，此时应迅速离开猪舍，将门关闭。经过12～24小时后方可将门窗打开通风。
2、猪舍的临时消毒和终末消毒。发生各种传染病而进行临时消毒及终末消毒时，用来消毒的消毒剂随疫病的种类不同而异。一般肠道菌、病毒性疾病，可选用5%漂白粉或1%～2%氢氧化钠热溶液。但如发生细菌芽孢引起的传染病（如炭疽、气肿疽等）时，则需使用10%～20%漂白粉乳、1%～2%氢氧化钠热溶液或其他强力消毒剂。在消毒猪只的同时，在病猪舍、隔离舍的出入口处应放置设有消毒液的麻袋片或草垫。
