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广西地区2019-2020年流行的非洲猪瘟病毒的遗传特征

猪相关 2022-07-08

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中国养猪产业庞大,且地域分布广泛,掌握不同地区流行的非瘟毒株的分子特征对于非瘟防控非常重要。非瘟于2018年8月在中国首次发现,之后短时间内迅速传播到大多数省份。据报道,中国猪群中同时存在基因I型和II型的非瘟毒株流行,并且在几个省份鉴定出了自然缺失的变异毒株。

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中国养猪产业庞大,且地域分布广泛,掌握不同地区流行的非瘟毒株的分子特征对于非瘟防控非常重要。非瘟于2018年8月在中国首次发现,之后短时间内迅速传播到大多数省份。据报道,中国猪群中同时存在基因I型和II型的非瘟毒株流行,并且在几个省份鉴定出了自然缺失的变异毒株。

 

广西动物疾病预防控制中心及广西大学的研究团队,使用实时定量PCR技术对2019~2020年间广西地区非瘟暴发期间现场采集的组织标本进行了非瘟检测。随机抽取阳性样本进行了扩增和测序,以分析广西地区非瘟流行株的遗传特征和变异情况。

 

在他们的研究中,从2019年1月到2020年12月,总计从14个地区86个不同猪场采集了336个来自不同猪只的组织样本。样本从疑似发生非瘟感染的猪场的死猪中采集。检测后,随机抽取阳性样本进行遗传分析。

 

他们的结果显示,所有样本的非瘟阳性率为57.14% (192/336)),阳性率较高。阳性样本中随机抽取进行遗传分析的有66份。在获得的66个分离株中,基因I型有8株,基因II型58株。所有66个分离株可以划分为两个血清群,血清群4(8/66)和8(58/66)。

 

广西流行的基因II型毒株与欧亚国家的部分毒株具有100%的同一性。I型毒株在NCBI数据库中没有找到100%相似的序列,最相似的毒株是葡萄牙OURT88/3毒株和西班牙NHV毒株,相似度为99.74%。

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