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01 非洲猪瘟病毒RNA加帽酶催化物的结构与生化特性研究
Xuejian Du, Zeng-Qiang Gao, Zhi Geng, Yu-Hui Dong, Heng Zhang, Joanna L. Shisler
Journal of Virology
https:// doi.org/10.1128/JVI.02029-20.
非洲猪瘟病毒（ASFV）是一种复杂的核质大DNA病毒（NCLDV），可引起严重猪瘟，因此，迫切需要开发有效抗ASFV的疫苗和药物。mRNA 5’端加帽反应是真核生物和许多病毒的共同特征，而帽子结构是mRNA稳定、高效翻译所必需的。研究发现，ASFV蛋白pNP868R具有鸟苷酰转移酶（GTase）活性，参与mRNA加帽反应。
本研究报告了pNP868R鸟苷酰转移酶（MTase）结构域（称为 pNP868RMT）的晶体结构。该结构表现为I类MTase家族的特征性核心折叠。值得注意的是，pNP868RMT的N端延伸是有序的，并且远离AdoMet结合位点。基于pNP868RMT帽模拟复合物模型的结构研究发现了用于底物识别和结合的基本残基。功能研究表明，N 端延伸可能在底物识别中起重要作用。
本文的研究成果为pNP868R催化的mRNA加帽酶的甲基转移过程提供了新见解。
原文链接：
http://read.newacademic.net/#/sci-search-detail?id=S016524272102005
02 非洲猪瘟病毒在掩埋野猪尸体中的存活研究
Laura Zani, Marius Masiulis, Paulius Bušauskas, Klaas Dietze, Gediminas Pridotkas, Anja Globig, Sandra Blome, Thomas Mettenleiter, Klaus Depner, Birutė Karvelien
Transboundary and Emerging Diseases
DOI:10.1111/tbed.13554
自1957年非洲猪瘟(ASF)首次传入欧洲野猪种群以来，科学家们一直在探讨该病毒在病死动物尸体中的存活问题。众所周知，非洲猪瘟病毒(ASFV)在环境中非常稳定。因此，感染野猪的尸体可能是ASFV的来源之一，可能导致病毒在野猪种群中的传播和扩散。为最大限度地减少这一风险，在ASF感染地区清除野猪尸体被认为是有效控制该病的关键。如果无法转移，尸体通常就地掩埋，以避免野猪直接接触传染源。
本研究挖掘了立陶宛不同时间和地点掩埋的感染ASFV的野猪尸体，并通过体外检测和qPCR检测病毒基因组。另外还对可能被体液污染的土壤样本进行了病毒基因组检测。在20个掩埋地点中，有17个地点出土的尸体样本呈ASFV基因组阳性。然而，在所有的尸体样本中均未分离到ASFV。另外，在七个地点的土壤样本中检测到非洲猪瘟病毒DNA。
以上结果出乎意料地否定了野猪尸体中的ASFV可不受掩埋时间影响而长期持久存在这一猜想。
原文链接：
http://read.newacademic.net/#/sci-search-detail?id=S016758772101017
03 中国猪瘟病毒分离株的系统发育分析
Zhu, Xiaofu.Liu, Mingjie.Wu, Xujin.Ma, Wentao.Zhao, Xuanduo
Archives of Virology
DOI:10.1007/s00705-021-05084-0
猪瘟(Classical swine fever, CSF)是由猪瘟病毒(Classical swine fever virus, CSFV)引起的一种严重疾病，在世界范围内给养猪业造成了巨大经济损失。在中国，自1954年以来，通过广泛的疫苗接种，CSF得到了有效控制。然而，在中国仍有零星的CSF暴发。
2011-2018年从中国3个省份(陕西、甘肃、宁夏)分离到27株CSFV。基于包膜糖蛋白E2编码区全长的系统发育分析表明，27株CSFV分离株中有25株聚集在2.1亚群和2.2亚群，而来自甘肃的2株分离株属于1.1亚群。27株分离株核苷酸序列同源性为79.3% ~ 99.8%，氨基酸序列同源性为83.1% ~ 99.7%。基于E2氨基酸序列的进一步分析表明，这些新分离株有一些相同的氨基酸被取代，如R31K和N34S。
原文链接：
http://read.newacademic.net/#/sci-search-detail?id=S186516822106042
04 日本期间的基因组变异
TatsuyaNishi KatsuhikoFukai TomokoKato KotaroSawai TakehisaYamamoto
Veterinary Microbiology
DOI:10.1016/j.vetmic.2021.109128
虽然RNA病毒具有广泛的序列多样性，但为确保维持病毒生命周期的蛋白质功能，突变率必须是有限的。本文比较了2018-2020年分离自日本的150株猪瘟病毒(CSFV)的全基因组序列。为评估CSFV基因组的多样性，消除对病毒传播产生负面影响的突变，以共享单核苷酸变异(SNVs)和共享单氨基酸变异(SAVs)作为评估对象。
12个蛋白质编码区的比较表明，多功能非结构蛋白NS3中SNVs和SAVs的百分比最低，在另一种非结构蛋白NS4A中未检测到SAVs。这表明负选择抑制了病毒传播过程中NS3和NS4A蛋白序列的变化。相比之下，仅在编码分泌蛋白Erns和非结构蛋白NS2的基因中检测到共享SNV之间的非同义替换，这表明流行期间存在正选择。将共享SAV映射到Erns 的三维结构显示共享SAV不存在于底物结合位点中，而是定位于蛋白质的外围区域。
以上数据可作为开发病毒基因的诊断方法、重组疫苗和抗病毒药物的数据支持。
原文链接：
http://read.newacademic.net/#/sci-search-detail?id=S037811352106016
05 快速高灵敏便携式检测非洲猪瘟病毒
Jade Daigle, Chukwunonso Onyilagha, Thang Truong, Van Phan Le, Bui Thi To Nga,Thi Lan Nguyen, Alfonso Clavijo, Aruna Ambagala
Transboundary and Emerging Diseases
DOI:10.1111/tbed.13770
非洲猪瘟(ASF)在亚洲持续扩散，造成较大负面影响。目前尚无ASF有效疫苗可用，因此，早期发现是有效控制该病的关键。以往的检测过程通常要求将样本运送至中心实验室，这可能需要数小时的运输时间，无法满足快速检测的要求。如果能够在现场或技术能力、基础设施有限的区域实验室就能确认是否存在ASFV感染，即可解决这些问题。
本文中，研究人员研发了一种高灵敏和高特异的便携式笔侧热循环仪，该方法可在现场操作，可从广泛的临床样本(包括口腔液等聚集样本)中手工提取核酸后，快速检测ASFV。通过现场测试越南7个疑似ASF农场的 89 份新鲜全血样本，本仪器的现场检测结果与第二天实验室获得的数据一致。说明，便携式检测仪的性能与基于实验室的荧光定量PCR检测相当。
当需要快速获得实验结果时，这种分子检测仪可免于将样品运送至中心实验室，极大缩短检测时间。
原文链接：
http://read.newacademic.net/#/sci-search-detail?id=S186516822105012
