猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)是一种高度传染性疾病,长期危害养猪生产,给养猪业造成巨大的经济损失。PRRSV可分为2个基因型,即PRRSV-1(欧洲型)和PRRSV-2(美洲型)。
自2011年在国内田间首次分离到蓝耳病欧洲株以来,到目前为止,PRRSV-1已在中国至少23个地区流行(哈兽研田志军和张洪亮团队:PRRSV-1已在中国超过23个地区流行https://mp.weixin.qq.com/s/2H1AG4CwXhJNO8v4HwfnyA)。
近期,哈尔滨兽医研究所田志军创新团队张洪亮课题组在对山东省PRRSV-1流行病学监测中发现一株源自两种商业化修饰的活疫苗Amervac和DV的重组毒株,并命名为TZJ2134。冠牧精准诊断学习后对内容进行了整理,希望能为广大养殖朋友在猪繁殖与呼吸综合征防控及净化过程中提供帮助。
研究发现:
(1)报告了中国首次蓝耳病欧洲株Amervac疫苗株与DV疫苗株的重组事件,该类疫苗未在国内批准上市;
(2)目前蓝耳病欧洲株疫苗重组毒株并未发现严重的临床症状,但不可忽视因毒株变异/重组等导致的毒力增强。
一、背景信息
2021年,研究人员在中国山东省一个小规模且未接种疫苗猪场里的一头流产母猪的肺脏样品中检测到PRRSV阳性,经RT-PCR和基因组测序鉴定为PRRSV-1,该分离株被命名为TZJ2134。
二、 TZJ2134株遗传进化与同源性分析
研究团队经过多次尝试,未能获得TZJ2134分离株全基因组序列,只获得了三个片段,TZJ2134-L12、TZJ2134-A、TZJ2134-B。将两个重叠片段的序列组装成一个重叠群【命名为TZJ2134-(A+B)】。
遗传进化与同源性分析表明, TZJ2134-(A+B)序列与 DV疫苗株和Amervac疫苗株具有高度核苷酸相似性(分别为97.1%和97.4%,表1)。DV和Amervac疫苗株均为商业化疫苗PRRSV-1 减毒活疫苗毒株。
表1 TZJ2134基因片段与PRRSV-1疫苗株的核苷酸相似性
三、 TZJ2134-(A+B)为DV疫苗株与Amervac疫苗株的重组毒株
系统发育分析表明,TZJ2134-(A+B)是Amervac-like分离株和DV-like分离株之间的中间体,并形成了单独的DV+Amervac-like亚群(图1)。
图1 基于 65 个 PRRSV-1 毒株的 TZJ2134-(A+B) 的系统发育树
RDP4工具分析结果表明TZJ2134(A+B)是一个从 Amervac 和 DV 疫苗株中分离出来的重组菌株,可能在Nsp10上存在重组。此外,SimPlot分析进一步证实了该重组事件,表明重组断点位于Nsp10(nt 9423)上( 图2A )。 重组断裂点不在两个核苷酸序列的连接处,因此TZJ2134是一种天然的重组病毒。根据推测的重组断点(nt9423),将TZJ2134(A+B)分为两个片段,即TZJ2134-A(nt7463-nt9423)和TZJ2134-B(nt9423- nt11272)。系统发育与同源性分析结果表明, TZJ2134-A属于 DV -like亚群(图2B),TZJ2134-B属于Amervac-like亚群(图2C)。
图2 TZJ2134-(A-B) 的重组分析及TZJ2134-A和TZJ2134-B的系统发育分析
A)TZJ2134-(A一B) 的重组分析。使用TZJ2134-(A/B) 作为查询序列,DV (蓝色) 和Amervac (绿色) 作为亲本菌株进行比较。DV亲本区域的背景色为灰色,而Amervac亲本区域的背景色为白色。B)TZJ2134-A的系统发育分析。亲本组 (DV样分离株) 以黄色显示。C) TZJ2134-B的系统发育分析。亲本组 (Amervac样分离株) 以紫色显示。
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