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猪流感病毒出现新变体,可能导致人际传播风险增加

科研圈 2020-06-30

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这种 G4 毒株由一种与欧洲和亚洲鸟类中发现的毒株类似病毒、引起 2009 年流感疫情的 H1N1 毒株、一种包含有禽类、人和猪流感病毒基因的北美 H1N1 毒株交换基因产生。
  · 公共卫生
 
  猪流感病毒出现新变体,可能导致人际传播风险增加

  · 公共卫生    猪流感病毒出现新变体,可能导致人际传播风险增加    图片来源:HONGLEI SUN    6 月 29 日,发表在美国科学院院刊(PNAS)上的一项研究指出,在中国境内发现了猪携带的一种 G4 基因型的 H1N1 流感病毒(G4 EA H1N1),这种由三个不同谱系病毒交换基因、进行“重排”后的病毒,可能导致人际传播风险增加。    这项研究由中国农业大学刘金华和中疾控主任高福共同担任通讯作者,分析了 2011 年到 2018 年间,在中国 10 个省份屠宰场采样的 30000 份健康猪鼻拭子和 1000 份有呼吸道症状的猪的鼻拭子数据。研究者从中检测到 179 种猪流感病毒,其中绝大多数为 G4 毒株或相关 G 系毒株。    这种 G4 毒株由一种与欧洲和亚洲鸟类中发现的毒株类似病毒、引起 2009 年流感疫情的 H1N1 毒株、一种包含有禽类、人和猪流感病毒基因的北美 H1N1 毒株交换基因产生。该病毒基因组的核心来自人类不具备免疫能力的禽流感病毒,还混杂着一些来自哺乳动物毒株的基因,这可能会增加人际传播风险。研究者呼吁,应加强对中国境内猪流感病毒的检测。(Science, PNAS)    刚果(金)东北部的埃博拉疫情结束    医护人员准备试验性埃博拉疫苗。图片来源:Baz Ratner/Reuters    当地时间 6 月 25 日,世界卫生组织和刚果(金)宣布,该国东北部的埃博拉疫情结束。此次疫情从 2018 年 8 月起在刚果(金)东北部多个省暴发,今年 4 月 27 日起不再出现新增病例。不过埃博拉疫情并未在刚果(金)彻底消失,6 月初新一轮埃博拉疫情在该国西北部发生。    刚果(金)东北部的这次疫情是该国 1976 年以来第 10 轮埃博拉疫情,最终累计报告病例 3470 ,其中 2287 例死亡。此次疫情中,由默克公司生产的疫苗首次进行了临床试验,目前已有 30 多万名密切接触者接种。超 80% 的疫苗接种者没有感染埃博拉,即便感染,病情也较轻。在疫情暴发期间进行的另一项临床试验还发现,两种基于抗体的药物 mAB114 和 REGN-EB3,可以显著降低感染后立即住院患者的死亡率。(Nature)    · 新型冠状病毒    瑞德西韦在发达国家每瓶定价 390 美元,5 天疗程需 2340 美元    6 月 29 日,吉利德科学宣布,瑞德西韦在发达国家的政府定价为每小瓶 390 美元。根据目前的治疗模式,预计绝大多数患者将接受 5 天疗程、一共 6 瓶的瑞德西韦治疗,相当于每位患者 2340 美元。该价格将提供给世界范围内批准或授权使用瑞德西韦的发达国家。    吉利德还表示,根据美国国家过敏和传染病研究所(NIAID)研究,瑞德西韦将住院的新冠肺炎患者平均恢复时间缩短了四天,以美国为例,较早出院可为每位患者节省约 12000 美元的医院费用。在医疗资源、基础设施和经济状况与发达国家不同的发展中国家,吉利德表示已经与仿制药生产商达成协议,以大大降低的成本提供治疗,这些替代解决方案旨在确保世界上所有国家都可以提供治疗机会。(吉利德科学官网,澎湃新闻)    · 大科学项目    南非削减平方公里阵列望远镜预算,推迟建设工期    图片来源:SOUTH AFRICAN RADIO ASTRONOMY OBSERVATORY    6 月 24 日,南非发布的预算公告称,在新冠疫情影响下,平方公里阵列射电望远镜 (SKA) 项目预算将被削减 2000 万美元。此外,今年南非整体的科学预算也将被削减 16% 以应对经济收入大幅减少、卫生和社会支出的增加。    SKA 是选址在南非和澳大利亚进行实地建设的国际大科学项目,计划在澳大利亚建造约 13 万个小型天线(用于收集低频信号),在南非建造近 200 个大型天线(用于收集中频信号),形成射电望远镜阵列。SKA 收集的数据将被用来绘制恒星的氢流动图,并研究宇宙中第一颗恒星如何诞生。该项目原计划于 2030 年完成,第一阶段耗资 10 亿美元。南非作为合作主办国将负担约 14% 的项目建设和运营成本。SKA 通讯主管 William Garnier 说,由于新冠病毒的流行,原定于今年年底开工的有关工程也将被推迟到 2021 年。(Science)    · 基因编辑    人类胚胎的基因编辑会导致染色体严重混乱    近日,发表在医学预印本平台 bioRxiv 上的三篇论文发现,使用 CRISPR–Cas9 对人类胚胎进行基因编辑,会对靶位点或其附近的基因组造成不必要的大变化。    此前,有实验表明使用 CRISPR-Cas9 编辑基因可以使“非靶”的基因突变远离目标位置。但在最新的研究中,Kathy Niakan 的团队使用 CRISPR-Cas9 在 POU5F1 基因(与肿瘤相关的基因)上产生突变,结果染色体片段均出现了缺失和重排,约 22% 经过基因组编辑的胚胎出现了预期外结果;Dieter Egli 领导的团队利用 CRISPR–Cas9 试图编辑携带致盲突变基因 EYS2 的精子形成的胚胎,结果约有一半胚胎丢失了 EYS 所在的大部分、甚至是整个染色体;Shoukhrat Mitalipov 的团队研究了由携带心脏病基因的突变精子形成的胚胎,发现基因编辑影响了突变基因所在染色体的大片区域,其中多达 40% 的变化是由 DNA 修复过程中一种叫做“基因转换”(gene conversion)的现象引起的。    Nature 对此进行了综述和点评。一些人认为使用 CRISPR-Cas9 的风险被低估了,而这三项研究给科学家们提供了一个很好的视角。(Nature,生物探索)    · 世界大学排名    2020 软科世界一流学科排名发布,中国内地高校 10 个学科世界第一    图片来源:软科    6 月 29 日,上海软科发布2020“软科世界一流学科排名(ARWU)”,共覆盖 54 个学科,涉及理学、工学、生命科学、医学和社会科学五大领域。该榜单从重要期刊论文数(Q1)、论文标准化影响力(CNCI)、国际合作论文比例(IC)、顶尖期刊论文数(Top)和教师或权威奖项数(Award)五个指标对全球4000余所高校进行排名。    在学科排名中,美国大学仍占绝对优势,共有 31 个学科夺冠;中国内地高校在 10 个学科夺得世界第一,仅次于美国,位列世界第二。其中,清华大学跻身全球拥有世界前十的学科数最多的 5 所高校(13 个学科),而北京大学为中国内地高校中百强学科数最多的高校(32 个学科)。(软科,科学网)    · 疫情通报    6 月 29 日全国新增确诊 19 例,其中北京 7 例    根据国家卫健委通报,6 月 29 日 0—24 时,31 个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例 19 例,其中境外输入病例 11 例(广东 4 例,上海 3 例,四川 3 例,甘肃 1 例),本土病例 8 例(北京 7 例,上海 1 例);新增无症状感染者 4 例(境外输入 3 例);当日转为确诊病例 3 例(境外输入 3 例)。截至 6 月 29 日 24 时,全国累计报告确诊病例 83531 例,累计死亡病例 4634 例。    根据世卫组织通报,截至欧洲中部时间 6 月 29 日 10:00(北京时间 6 月 29 日 16:00),过去 24 小时内全球新增确诊病例 178 328 例,新增死亡病例 4 153 例;全球累计确诊病例 10 021 401 例,累计死亡病例 499 913 例。(国家卫生健康委员会,世界卫生组织)
  图片来源:HONGLEI SUN
 
  6 月 29 日,发表在美国科学院院刊(PNAS)上的一项研究指出,在中国境内发现了猪携带的一种 G4 基因型的 H1N1 流感病毒(G4 EA H1N1),这种由三个不同谱系病毒交换基因、进行“重排”后的病毒,可能导致人际传播风险增加。
 
  这项研究由中国农业大学刘金华和中疾控主任高福共同担任通讯作者,分析了 2011 年到 2018 年间,在中国 10 个省份屠宰场采样的 30000 份健康猪鼻拭子和 1000 份有呼吸道症状的猪的鼻拭子数据。研究者从中检测到 179 种猪流感病毒,其中绝大多数为 G4 毒株或相关 G 系毒株。
 
  这种 G4 毒株由一种与欧洲和亚洲鸟类中发现的毒株类似病毒、引起 2009 年流感疫情的 H1N1 毒株、一种包含有禽类、人和猪流感病毒基因的北美 H1N1 毒株交换基因产生。该病毒基因组的核心来自人类不具备免疫能力的禽流感病毒,还混杂着一些来自哺乳动物毒株的基因,这可能会增加人际传播风险。研究者呼吁,应加强对中国境内猪流感病毒的检测。(Science, PNAS)
 
  刚果(金)东北部的埃博拉疫情结束
 
猪流感
  医护人员准备试验性埃博拉疫苗。图片来源:Baz Ratner/Reuters
 
  当地时间 6 月 25 日,世界卫生组织和刚果(金)宣布,该国东北部的埃博拉疫情结束。此次疫情从 2018 年 8 月起在刚果(金)东北部多个省暴发,今年 4 月 27 日起不再出现新增病例。不过埃博拉疫情并未在刚果(金)彻底消失,6 月初新一轮埃博拉疫情在该国西北部发生。
 
  刚果(金)东北部的这次疫情是该国 1976 年以来第 10 轮埃博拉疫情,最终累计报告病例 3470 ,其中 2287 例死亡。此次疫情中,由默克公司生产的疫苗首次进行了临床试验,目前已有 30 多万名密切接触者接种。超 80% 的疫苗接种者没有感染埃博拉,即便感染,病情也较轻。在疫情暴发期间进行的另一项临床试验还发现,两种基于抗体的药物 mAB114 和 REGN-EB3,可以显著降低感染后立即住院患者的死亡率。(Nature)
 
  · 新型冠状病毒
 
  瑞德西韦在发达国家每瓶定价 390 美元,5 天疗程需 2340 美元
 
  6 月 29 日,吉利德科学宣布,瑞德西韦在发达国家的政府定价为每小瓶 390 美元。根据目前的治疗模式,预计绝大多数患者将接受 5 天疗程、一共 6 瓶的瑞德西韦治疗,相当于每位患者 2340 美元。该价格将提供给世界范围内批准或授权使用瑞德西韦的发达国家。
 
  吉利德还表示,根据美国国家过敏和传染病研究所(NIAID)研究,瑞德西韦将住院的新冠肺炎患者平均恢复时间缩短了四天,以美国为例,较早出院可为每位患者节省约 12000 美元的医院费用。在医疗资源、基础设施和经济状况与发达国家不同的发展中国家,吉利德表示已经与仿制药生产商达成协议,以大大降低的成本提供治疗,这些替代解决方案旨在确保世界上所有国家都可以提供治疗机会。(吉利德科学官网,澎湃新闻)
 
  · 大科学项目
 
  南非削减平方公里阵列望远镜预算,推迟建设工期
 
猪流感
  图片来源:SOUTH AFRICAN RADIO ASTRONOMY OBSERVATORY
 
  6 月 24 日,南非发布的预算公告称,在新冠疫情影响下,平方公里阵列射电望远镜 (SKA) 项目预算将被削减 2000 万美元。此外,今年南非整体的科学预算也将被削减 16% 以应对经济收入大幅减少、卫生和社会支出的增加。
 
  SKA 是选址在南非和澳大利亚进行实地建设的国际大科学项目,计划在澳大利亚建造约 13 万个小型天线(用于收集低频信号),在南非建造近 200 个大型天线(用于收集中频信号),形成射电望远镜阵列。SKA 收集的数据将被用来绘制恒星的氢流动图,并研究宇宙中第一颗恒星如何诞生。该项目原计划于 2030 年完成,第一阶段耗资 10 亿美元。南非作为合作主办国将负担约 14% 的项目建设和运营成本。SKA 通讯主管 William Garnier 说,由于新冠病毒的流行,原定于今年年底开工的有关工程也将被推迟到 2021 年。(Science)
 
  · 基因编辑
 
  人类胚胎的基因编辑会导致染色体严重混乱
 
  近日,发表在医学预印本平台 bioRxiv 上的三篇论文发现,使用 CRISPR–Cas9 对人类胚胎进行基因编辑,会对靶位点或其附近的基因组造成不必要的大变化。
 
  此前,有实验表明使用 CRISPR-Cas9 编辑基因可以使“非靶”的基因突变远离目标位置。但在最新的研究中,Kathy Niakan 的团队使用 CRISPR-Cas9 在 POU5F1 基因(与肿瘤相关的基因)上产生突变,结果染色体片段均出现了缺失和重排,约 22% 经过基因组编辑的胚胎出现了预期外结果;Dieter Egli 领导的团队利用 CRISPR–Cas9 试图编辑携带致盲突变基因 EYS2 的精子形成的胚胎,结果约有一半胚胎丢失了 EYS 所在的大部分、甚至是整个染色体;Shoukhrat Mitalipov 的团队研究了由携带心脏病基因的突变精子形成的胚胎,发现基因编辑影响了突变基因所在染色体的大片区域,其中多达 40% 的变化是由 DNA 修复过程中一种叫做“基因转换”(gene conversion)的现象引起的。
 
  Nature 对此进行了综述和点评。一些人认为使用 CRISPR-Cas9 的风险被低估了,而这三项研究给科学家们提供了一个很好的视角。(Nature,生物探索)
 
  · 世界大学排名
 
  6 月 29 日,上海软科发布2020“软科世界一流学科排名(ARWU)”,共覆盖 54 个学科,涉及理学、工学、生命科学、医学和社会科学五大领域。该榜单从重要期刊论文数(Q1)、论文标准化影响力(CNCI)、国际合作论文比例(IC)、顶尖期刊论文数(Top)和教师或权威奖项数(Award)五个指标对全球4000余所高校进行排名。
 
  在学科排名中,美国大学仍占绝对优势,共有 31 个学科夺冠;中国内地高校在 10 个学科夺得世界第一,仅次于美国,位列世界第二。其中,清华大学跻身全球拥有世界前十的学科数最多的 5 所高校(13 个学科),而北京大学为中国内地高校中百强学科数最多的高校(32 个学科)。(软科,科学网)
 
  · 疫情通报
 
  6 月 29 日全国新增确诊 19 例,其中北京 7 例
 
  根据国家卫健委通报,6 月 29 日 0—24 时,31 个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例 19 例,其中境外输入病例 11 例(广东 4 例,上海 3 例,四川 3 例,甘肃 1 例),本土病例 8 例(北京 7 例,上海 1 例);新增无症状感染者 4 例(境外输入 3 例);当日转为确诊病例 3 例(境外输入 3 例)。截至 6 月 29 日 24 时,全国累计报告确诊病例 83531 例,累计死亡病例 4634 例。
 
  根据世卫组织通报,截至欧洲中部时间 6 月 29 日 10:00(北京时间 6 月 29 日 16:00),过去 24 小时内全球新增确诊病例 178 328 例,新增死亡病例 4 153 例;全球累计确诊病例 10 021 401 例,累计死亡病例 499 913 例。(国家卫生健康委员会,世界卫生组织)

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