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处理方法一般分为干燥处理，堆肥处理，固体液体分离处理三种：
干燥处理：国内外畜禽粪便干燥设备有多种，目前国内就有烘干，膨化，微波处理等各种型号的机具产品，其主要作用是使物料迅速脱水，一般都伴随温度，从而使水分降至15%以下，并杀死一切微生物，蠕虫及卵，防治细菌分解和产生恶臭，并使物料便于储存和运输。
堆肥处理：堆肥处理亦即圆形粪污的好氧发酵。近几年来国外好氧发小设备已经有少量引进。其原理是：好氧细菌分解有机质产生二氧化碳，
水喝热，发酵过程中物料温度逐渐升高，最高可达到60-70℃，从而杀灭病微生物，蠕虫，同时复杂的有机质也被分解为简单的化合物，成为无臭，安全，高效的有机肥。
固液分离：固体分离除采用自然沉淀法外，有条件的猪场还可以采用机械分离法。采用机械分离时，固体物的含水率一般要达至70%-80%。
总而言之，通过物理方法，生物方法等处理，使粪便达到无臭，无害的目的，既利用了高效有机肥，又起到了保护环境的作用。
