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常用的消毒剂包括：酚类、醛类、醇类、酸类、碱类、氯制剂、氧化剂、碘制剂、重金属盐和表面活性剂等。
酚类
包括苯酚、煤酚、复合酚等，有特殊臭味。低浓度时防腐，高浓度时杀菌，受有机物影响大。
苯酚可杀灭细菌繁殖体，对芽胞、病毒无效。，2~5％水溶液可消毒污物、用具、车辆、墙壁、运动场及动物圈舍；忌与碘、溴、高锰酸钾、过氧化氢等配伍，不适创伤、皮肤。
煤酚有臭味，杀菌力比苯酚强3倍，能杀灭繁殖体，但对芽胞较差。含50%煤酚的皂溶液加水后可用于皮肤消毒(2％)、器械、物品消毒(3~5％)及圈舍及排泄物等消毒(5~10％)。
复合酚为含41~49％酚和22~26％醋酸的混合物，有臭味，能杀灭细菌、霉菌、病毒和虫卵，1%水溶液可用于圈舍、笼具、排泄物等的消毒。但不得与碱性药物或其他消毒液混用。
醇类
醇类的杀菌力主要是能够去除细菌细胞膜中的脂质并使菌体蛋白凝固和变性。常使用的醇类消毒剂为乙醇，无水乙醇的杀菌力很低，加水稀释成70％(w/v)或77％(v/v)的酒精杀菌作用最强，但只能杀死细菌的繁殖体，对细菌芽胞无效。
主要用于皮肤及器械的消毒。
醛类
醛类消毒剂有甲醛、聚甲醛和戊二醛等。
甲醛的熏蒸消毒时，污染较轻的空间通常按7克/m3高锰酸钾加入14毫升福尔马林熏蒸消毒；如果污染严重则常将上述两种药品的用量各增加l-2倍。熏蒸消毒时，室温不应低于15℃，相对湿度应为60~80％；先在容器中加入高锰酸钾，再加入福尔马林溶液，密闭门窗7小时以上即可敞开门窗通风换气、消除残余的气味。
多聚甲醛为白色疏松粉末，本身无杀菌作用，但加热至80~100℃时能产生大量的甲醛气体而呈现强大的杀菌作用。使用注意事项与甲醛相似，要求较高的温度和湿度。
酸类
酸类有抑菌和抗菌作用，包括有机酸和无机酸。
无机酸中盐酸和硫酸具有强大的杀菌和杀芽胞作用，但对组织细胞、纺织物品、木质用具和金属制品等具有强烈的刺激和腐蚀作用，应用受到限制，但常用2％盐酸加食盐15克浸泡炭疽芽胞污染的皮张40小时以进行消毒。
有机酸中的乳酸和醋酸具有杀菌和抑菌作用，适用于空气消毒。乳酸蒸气消毒时，将适量乳酸加水稀释成20％浓度后，在密闭空间内置于器皿中加热蒸发30~90分钟即可。有时也用食醋来代替乳酸用于空气消毒，但效果不如乳酸。
有时也用草酸和甲酸溶液以气溶胶形式消毒口蹄疫或其他传染病病原体污染的房舍。
碱类
包括氢氧化钠、氢氧化钾、石灰、草木灰等。
碱制剂对细菌、病毒和细菌芽胞都具有强大的杀灭作用，可用于多种传染病的消毒。但碱溶液具有腐蚀作用，操作时应注意防护。
氢氧化钠和氢氧化钾：使用时配1~2％水溶液，消毒被细菌或病毒等污染的圈舍地面、墙壁、运动场和污物以及屠宰场、食品厂等地面。喷洒6~12小时后应水洗，防止造成动物肢蹄、趾足和皮肤的损伤。
生石灰与水混合时可生成氢氧化钙，对细菌繁殖体有效，但对芽胞和结核杆菌无效。可用于涂刷消毒动物的圈舍、墙壁和地面。应注意石灰乳放置时间过久，消毒能力降低。
卤素类
卤素以及容易释放出卤素的化合物均有强大的杀菌能力，其作用机理是卤原子易渗入细胞内与菌体蛋白的氨基或其他基团相结合而发挥卤化作用，使其中的有机物分解或丧失功能呈现杀菌作用。
在卤素中以氟、氯的杀菌力最强，其次为溴、碘，但氟和溴一般不用作消毒药。
氯制剂
包括漂白粉和此氯酸钠等，依靠释放的气态氯及其遇水后生成的次氯酸而发挥杀菌作用。
漂白粉新制时含有效氯25~30％，当降低至16%时便失去消毒作用。能杀灭细菌及其芽胞、病毒及真菌等，且在酸性环境中杀菌力强。5%溶液可对圈舍、笼架、饲槽及车辆等进行喷洒消毒；暴发炭疽时用10~20％乳剂消毒被污染的圈舍、粪池、排泄物、运输车辆及其他场所。
碘制剂
常用的碘制剂包括碘酊、碘甘油及络合碘。
碘可杀死细菌、芽胞、霉菌和病毒及原虫等，在酸性环境中杀菌力强，而在碱性环境或有机物存在时，其杀菌力弱。
碘酊含碘2~5％，可用于手术部位、注射部位的消毒，也用于皮肤霉菌病的治疗。
碘甘油为含碘1％的甘油制剂，常用于口炎、咽炎和病变皮肤等局部的涂擦。
络合碘则是碘与非离子表面活性剂、阴离子表面活性剂的络合物，高效广谱、药效持久、性能稳定，对细菌、病毒和霉菌等病原体的杀灭作用强，在酸性环境中的杀菌能力更强。可用于环境、用具的喷雾消毒，种蛋的浸洗消毒、孵化器的洗刷消毒和发病动物群的消毒。
氧化剂类
常用制剂有高锰酸钾、过氧乙酸等。
高锰酸钾遇有机物或加热、加酸或碱均能放出初生态氧，在酸性溶液中作用增强，具有杀菌、杀病毒、除臭和解毒等作用，高浓度时有刺激和腐蚀作用。0.1％水溶液能杀死细菌繁殖体，2~5％溶液能杀死细菌芽胞。常用于皮肤、粘膜以及与福尔马林混合进行熏蒸消毒。
过氧乙酸性质不稳定、易挥发，但氧化作用很强。市售产品浓度为20％，4~10℃密闭避光可贮放约6个月，稀释后药效能维持3~7天。对细菌、病毒、霉菌和芽胞有效，对组织有刺激性和腐蚀性。0.5%用于圈舍、饲槽、车辆等喷洒消毒；0.04~0.5％用于污染物品的浸泡消毒；5％溶液可用于实验室、无菌室、动物圈舍、仓库、屠宰车间等喷雾消毒，用量约为2.5ml/m3。有时也进行熏蒸消毒，即按1~3克/m3，配成3~5％溶液加热熏蒸消毒l~2小时。
表面活性剂类
阴离子、阳离子及不电离的表面活性剂三种。
阳离子表面活性剂的抗菌作用强、抗菌谱广、作用快，能杀灭多种革兰阳性菌和革兰阴性菌，且对病毒和霉菌也有一定的抑制和杀灭作用，故应用较广，但杀菌效力可被有机物及阴离子表面活性剂如肥皂等抑制或抵消。
新洁尔灭为阳离子表面活性剂，兼有杀菌和去污效力，易溶于水、性质稳定。对肠道菌、化脓菌及部分病毒有较好的杀灭作用。0.1％溶液可用于皮肤、粘膜及器械的消毒，也可用于动物圈舍、孵化场、环境的喷雾消毒。
该类消毒剂还有洗必泰、杜灭芬、消毒净等，它们都是广谱的消毒剂，对革兰阴性菌和阳性菌均有较强的杀灭作用。
