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在目前的养殖过程中，猪价高低起伏以及饲料成本居高不下，增效降本是企业在现行市场环境中生存下来的必要手段。而在养殖饲养环节中很容易忽略猪的四肢疾病，特别是四肢无力（骨软骨病），会导致生产力下降而让公司承受巨大的经济损失。此外，养殖过程中面对的一个严重问题是飞结帽（因遗传或病变在关节处产生类似帽子的凸起）和滑囊炎的反复发作。
飞节滑囊炎通常发生在后肢飞节下方，在前肢较少见。飞节帽被认为类似于飞结关节病变，因此飞节帽和滑囊炎的研究通常结合在一起。帽节通常只是一个缺陷，不会导致跛行，但这极大地影响了种猪的外表。在销售环节，会因为这个方面的缺陷导种猪销售价格降低，从而对养殖效率产生了极其负面的影响。
目前的研究表明管理环境和遗传因素是帽节病因的主要因素。随着基因分型技术的逐渐成熟，目前也有越来越多的研究使用基因芯片来揭示与帽节问题直接或间接相关的基因组区域，寻找可成为家畜有价值性状的候选基因。
目前有研究表明使用平滑FST法对两个长白猪群体进行比较，发现了38个SNPs组成的显著区。这些区域与QTLS1(n=147)重叠，它们代表与健康性状（血液参数和免疫能力）、肉和胴体性状（解剖、肥满度、肉色和质地）、繁殖性状（窝仔性状和生殖器官）、外部性状（行为、缺陷、构象和被毛特征）和生产性状（体重和100公斤日龄）有关的性状。在这些区域中，共鉴定出17个基因（表 1).
在富集分析中确定了两个主要途径。首先是钙粘蛋白信号通路，它参与许多生物过程，如发育、神经发生、细胞粘附和炎症。 其次是Wnt信号通路，它是动物体内调控胚胎发生、细胞分化和恶性肿瘤发生的信号通路之一。
在两个杜洛克猪群体的基因组中，共鉴定出32个具有强异常值的SNPs。这些区域与49个QTL重叠。对肉用性状和胴体性状的QTLs进行鉴定，发现了32个QTLs。其中与肌内脂肪含量相关、繁殖性状、健康性状、生产性状和外部性状相关。在这些区域，共鉴定了14个基因（表 2)。
表12在两个杜洛克猪群体中鉴定的基因
在富集分析的基础上，确定了两条途径。首先是Notch信号通路，它在胚胎发生和体细胞发生中起着一定的作用。其次是烟碱乙酰胆碱受体信号通路，参与两种主要类型的神经传递：突触传递（如神经递质释放）和旁分泌传递。其中A2ML1(SSC5)、Robo2(SSC13)和MSI1(SSC14)基因在长白猪和杜洛克中均有表达。
从目前的研究来看飞结帽的产生和易感性可能是通过与脂质和脂肪酸组成、血液学性状和疾病易感性有关的遗传变异进行控制的。
在对这种性状进行选择时，常规的表型选择是无法真正选择出可以稳定遗传给后代的优良个体的。因此就需要借助准确高效的基因分型技术，对种猪的基因型进行准确分型，高效分析，从基因层面确定个体的种用潜力。更好的选择符合育种目标和管理方式的种猪个体。最终建立一个稳定优良的核心群体，实现持续高增长的经济效益。
作者简介
刁照希：猪基因组育种技术经理
简介：本硕均就读于西北农林科技大学，一直专注于猪分子遗传育种工作。在现场采样管理、基因组检测、育种方案设计、生信分析结果解读等方面有着较为丰富的经验。
文章译自：“Genomic Regions and Candidate Genes Linked to Capped Hock in Pig，Lyubov Getmantseva, etl, 2021”。
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