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众所周知，疫苗研发的关键是优秀毒株的筛选。不同种类的疾病因其病源特性不同，疫苗研制过程中会筛选不同种类的毒株作为种毒，例如猪瘟疫苗选择中国研究的全球最好的毒株C株作为种毒，伪狂犬疫苗选用全球广泛应用的自然基因缺失毒株Bartha-K61作为种毒。
但是在口蹄疫疫苗研发过程中，因为口蹄疫病毒血清型众多、交叉保护力弱，而且不断的变异，在口蹄疫疫苗的研究生产中，种毒也是在不断的更新。近年来，众多研究并经临床证实经过反向遗传技术改造的毒株比自然分离的毒株更具有优势，如Re-O/MYA98/JSCZ/2013、Re-A/WH/09。
现将自然分离毒株和反向遗传技术改造毒株从6个方面进行总结如下：
反向遗传改造的毒株
有哪些优势
通过上表比较，经过反向遗传改造的毒株具有一低五高的优势，成为当前口蹄疫疫苗毒株研发生产的重要方向。
一低
毒力降低，生物安全性提高
五高
交叉保护力强
免疫应答速度增快
抗体保护期增长
细胞免疫水平提高
病毒培养含量高
目前已有多种采用反向遗传技术改造的毒株作为种毒疫苗上市，为口蹄疫的防控提供更优质的产品和更好的选择。 “泰吉联”猪口蹄疫O型、A型二价灭活疫苗（Re-O/MYA98/JSCZ/2013+Re-A/WH/09）的种毒是通过反向遗传技术改造成功的第一个口蹄疫疫苗，获得了国家“一类新兽药证书”。
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