现代育种技术使养猪产业的生产效率得到提升，其中最主要的体现就是高产母猪的培育。当所有育种公司都专注于提高母猪产仔数时，有一些性状也同时被筛选掉了。
母猪是怎么变高产的？
长期以来，欧洲种猪产活仔数基本在10.5头上下徘徊。针对提高产活仔数进行选育被认为是不值得虑的，因为遗传力太低（8-10%）。
1960s-1970s年代，法国科学家开始着眼于鉴别出高产仔数亚群，希望以此来培育“高产”母猪。
1980年代晚期，四个英国育种公司组成的团体联合了位于苏格兰爱丁堡的罗斯林研究所，从中国进口了一批梅山猪。自此，梅山猪的高产基因开始进入商业猪群。
1990年代中期，基因技术的发展使人可以找到与高产相关联的具体基因，从而使遗传选育获得革命性进步。
之后，所有主流育种公司都在产活仔数上取得了巨大进步，窝均产仔数达到14-16在商业猪场中很常见。见下表。
丹麦种猪分娩效率变化（1996-2009）
在追求高产的同时，也给现代种猪带来一些缺点，以下有四条。
一、 断奶前死亡率
由于产仔数的增多，使仔猪在子宫中的生长受到限制，仔猪的平均初生重下降，而且会出现相对较多比例的弱仔（800g以下）。根据经验，初生重下降100g，生长猪下降1kg，出栏末体重下降10-15公斤。在全进全出系统中，这种猪要么被降级，要么只能增加出栏日龄。
产仔数的增加也导致断奶前死亡率的提高。这在一些动物福利组织的眼中是无法接受的，在一些国家，这些组织向政府提出的动议包括降低断奶前死亡率，甚至要求降低产仔数。
二、背膘与肉质风味
提高瘦肉率也是现代种猪的育种目标之一，其中背膘是重要的选育指标。背膘的遗传力较高，选育容易实现，并且引入一些极瘦猪如皮特兰的基因，使得猪的瘦肉率快速提高。
但是，一些关于肉质的指标，比如嫩度、滴水损失、pH、肉色、风味以及多汁程度基本都与瘦肉率呈强的负相关关系。因此90-105kg背膘在11-13mm左右的现代肉猪的肉质口感又瘦又柴，索然无味。
三、肢蹄问题
老话说“好马出在腿上”，这句话对于现代养猪业尤其适合移植。在一项针对北美44个公猪站的研究中，81%的公猪站认为，公猪淘汰的主要原因是肢体问题。另一项研究显示，美国育肥猪群中因肢蹄问题导致的死亡占到9%。肢蹄问题也是母猪淘汰的重要原因。
四、疝气及其他缺陷
1980年代以前，一窝猪种如果出现遗传缺陷（疝气、八字脚等），整窝仔猪都不会用于种用，以避免缺陷基因的流传。
但是现在并不再这么操作，几乎所有育种公司都执迷于提高最高可能测试数量以提高“未成熟到总计比例（I/T比）”。这导致在商品代中通常会有2-3%的遗传缺陷率。
