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怎样才能评价乙脑疫苗的免疫效果呢？这是很多猪场老板和技术总监关心的问题。
首先，通过肉眼进行观察是否出现猪乙型脑炎的病症。猪乙型脑炎属于国家二类动物疫病，是引起猪繁殖障碍性综合症的主要病毒性疾病之一，主要特征：以流产和生产异常为特征的生殖障碍，产出大小不等的死胎，畸形胎，木乃伊胎及脑积水和皮下水肿的弱仔；也比如后备母猪猪体温升至40-41℃，精神萎靡，后肢轻度麻痹，步态不稳，关节肿大，跛行；公猪感染导致单侧或者两侧性睾丸的水肿、充血。
此外由于病毒有嗜神经性则突破血脑屏障侵入中枢神经系统并在神经细胞内复制增殖，导致急性发病，患病幼畜精神沉郁，食欲减退，呈现稽留热，摇头、乱冲撞最后身躯麻痹而死。
其次，通过血清学方法来衡量免疫疫苗后的抗体水平的变化情况，如：间接免疫荧光法、血凝抑制试验、中和试验、ELISA等，其中目前最常用的还是ELISA方法，能够快速诊断和大规模检测。目前市面上有两家市场化的诊断试剂盒，包被的抗原是能够刺激机体产生中和抗体的E蛋白，但是该蛋白是一个疏水性蛋白，体外表达的产物以包涵体的形式存在，影响了蛋白的天然构象，其只能检测到针对线性表位的抗体，而针对构象表位抗体的检测结果要低于可溶性蛋白，而且其稳定性较差，蛋白的小量降解会影响ELISA方法的检测效果。因此，诊断试剂盒的检测结果也不能完全衡量疫苗免疫后的猪群的保护率。
再次，通过测量细胞免疫的成分如干扰素、细胞因子的变化来衡量免疫疫苗后的保护率。目前也有商品化的试剂盒：美国RD公司生产的IFN-ㄚ的ELISA检测试剂盒等。目前市面上有两种猪乙型脑炎的疫苗：灭活苗和猪用乙脑活疫苗SA14-14-2株。2011年，乔等研究发现乙脑活疫苗试验组产生的干扰素的量明显比乙脑灭活疫苗试验组产生的高。灭活疫苗中的病毒成分不会产生细胞免疫成分，只是灭活疫苗的佐剂刺激机体产生少量的细胞免疫，因此，目前应用猪用乙脑活疫苗对于防控目前乙脑疾病具有更好的效果。
综上所述，衡量猪用乙脑疫苗的免疫效果不能通过单一因素来判断疫苗免疫后的效果，临床观察、抗体水平的监测、细胞免疫水平的分析等方法进行综合判断，首先通过血清学方法ELISA来初步判断一下免疫后的抗体水平的变化，然后再结合临床症状、细胞免疫等方面进行判定。
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