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非瘟变异株包括基因缺失株、自然变异株、自然弱毒株等，与传统的流行毒株相比，该类毒株的基因组序列、致病力等发生明显变化（来自农业农村部）。生猪感染该类毒株后，排毒滴度低，间隙性排毒，难以早期发现，潜伏期延长，临床表现轻微，后期可出现关节肿胀、皮肤出血型坏死灶，感染母猪产仔性能下降、死淘率增高，出现流产、死胎/木乃伊胎等。
一、非瘟变异株的流行特点
非瘟变异株已成为我国非瘟防控中新的传染源，已形成一定的扩散面和污染面，加大了我国非瘟疫情的复杂性，其危害不容忽视。非瘟变异株具有以下特点：
（一）隐蔽性强
变异株感染潜伏期长，初期无临床表现或临床症状不典型，致死率较低。有的猪场猪群没有任何临床症状，检测却发现CT值很低。有的猪场误以为是假阳性，未及时采取有效措施，结果造成病毒扩散，在应激和混合感染等因素的诱发下，导致疫情发生。
（二）检测难度大
变异株感染前期病毒滴度较低，感染后产生抗体延迟，因此，更为敏感和更为特异的检测方法才有可能检测到抗原或抗体。有的猪场出现疑似非瘟的异常现象和感染迹象，但抗原、抗体检测却是阴性的，解剖后能在肺、关节液、扁桃体、脾脏、淋巴结等器官中检测到病原。因此，如果过分相信检测结果，则会贻误最佳处置时机，致使疫情蔓延。由于变异株感染后存在间歇排毒现象，建议全群、多种类样品、多频次采样检测，且不放过对任何临床异常猪只的检测。但过度检测又可能导致交叉污染或扩散，猪场务必保持高度的生物安全意识，人力不足或员工生物安全意识较差的猪场慎重采取全群普查的方法。
（三）依然有传染性
变异株仍然会在猪群中存在和传播。在漫长的潜伏期内，经多次转群、并群等操作，感染源可能遍布多栋猪舍，因此，变异株呈现多点同时发病的特点。
（四）临床表现不典型
临床常表现为采食量下降、体表发红、皮肤坏死、体温正常，淋巴结肿大，肺炎；母猪产死胎/木乃伊胎，出现胚胎死亡、不育及流产，初生仔猪活力差，如果存活到生长育肥阶段，会排毒感染其他猪只。显微镜下多器官可见带有梗塞和血栓的活跃坏死和出血区，以及慢性纤维化病变，特别是在淋巴结和肾脏上肉眼可见。
二、监测方法
农业农村部提出了科学的监测方法。
（一）加强临床巡视
时刻关注猪场各个环节猪只异常情况，一旦发现猪只出现嗜睡、轻触不起、采食量减少、发热，皮肤发红、关节肿胀/坏死，咳喘、腹式呼吸，育肥猪死淘率增高，母猪流产或出现死胎/木乃伊胎等可疑临床表现时，应第一时间采样检测。
（二）改进主动监测
每周对猪群进行病原和抗体检测，在猪群进行疫苗接种、转群、去势、母猪分娩等应激行为后，猪场出现暴露风险或周边猪场出现感染时，进行采样检测。
（三）抽样策略
对可疑猪的同舍和关联舍猪群，采集深部咽拭子和抗凝血，进行病原检测，必要时采集血清进行抗体检测。对可疑猪及临近猪接触的地面、栏杆，以及舍内人员接触的物品等，采集环境样品进行病原检测。混检时，混样数量不超过5个；抗体检测不得混样。
（四）样品选择
1.可疑猪样品：深部咽拭子、淋巴结（微创采集）、前腔静脉抗凝血（EDTA）或尾根血、口鼻拭子等。口腔拭子对于变异株不太敏感，特别是出现厌食症状的早期，通过唾液较难检测到变异株的核酸。变异株有时可能不会在血液中存在，血液阴性时可能会在淋巴结、肺、关节液等组织中检测到。
2.分娩母猪样品：脐带血、胎衣。
3.死胎和流产胎儿样品：淋巴结、脾脏等组织样品。
4.病死猪：淋巴结、脾脏、骨髓和肺脏等。
（五）检测方法
病原检测方法为（P72/CD2v/MGF360）三重荧光PCR方法检测核酸，必要时可测序鉴别；抗体检测方法为间接ELISA、阻断ELISA等方法。
