近期,蓝耳1-4-4谱系1C变异株在美国的流行引发行业关注。那么该毒株在美国是如何被发现的?目前的流行情况如何?对养猪场造成了哪些危害?是否会与现有毒株重组?11月24日 ,由赛默飞主办的“聚焦蓝耳1-4-4”直播节目特别邀请了来自美国的三位临床兽医专家Giovani Trevisan博士、Daniel Linhares博士和Paul Yeske博士,分别就蓝耳1-4-4谱系1C变异株在美国的发现过程、流行动态、临床表现以及防控措施进行交流。本节目由猪兜TV全程直播,共吸引了14.4万人次在线观看。
首先,Giovani Trevisan博士和Daniel Linhares博士回顾了蓝耳 1-4-4 谱系1C变异株的发现过程以及在美国的流行情况和目前的检测方案。
为获取美国疫病诊断和病原体检测的实时信息,美国养猪业建立了猪病报告系统(SDRS),以帮助和支持疫病管理以及防控决策,该项目从5个兽医诊断实验室获取实时的信息,这些信息代表了在美国国家实验室网络中所采集和检测的95%以上的样品,包括常见病原如PRRSV、丁型冠状病毒、猪肺炎支原体、TGEV等的数据信息。对于PRRS,RFLP图谱以及基于ORF5测序获得的谱系信息帮助我们发现了1-4-4新型毒株并了解其相关的分子生物学信息。
PRRSV是一种常见病原体,在美国大部分地区传播。通过实验室网络检测发现,2020年底和2021年初的这段时间内,实际检测的数据高于预期。
上面红色曲线表示从断奶到出栏猪群的PRRSV阳性率,蓝色曲线表示母猪场的阳性率情况。我们发现一个奇怪的效应,每年下半年在从断奶到出栏猪群中,PRRSV的检出率增加,这发生在母猪场PRRSV检出之前,母猪场PRRSV检出率也因此增加,由于在先的效应,使得各个猪群中的病毒检出率迅速增加。2020年1月第一次检出时,这种毒株被追溯鉴定为1-4-4谱系1C变异株。2021年10月,1-4-4毒株的PRRSV检出率大幅上升,于是形成了新的波动。
在PRRSV检测数据方面,我们观察到在爱荷华州和明尼苏达州采集的从断奶到出栏猪群样品的Ct值发生了显著变化,先是在2020年6月,Ct值有所下降,10月之后的另一次下降使这两个州在那几个月中处于较低的起始水平。2021年夏季,这两个州的CT值显著下降,并且从断奶到出栏猪群的PRRSV毒株检出率升高,与检测到的真实波动相吻合。
在美国,我们大量使用PRRS ORF5测序,以根据RFLP类型和谱系对毒株进行分类。ORF5只是基因组的一部分,它由603个碱基对(2型PRRSV)或606个碱基对(1型PRRSV)组成,占基因组的4%。最初用于根据限制性片段长度多态性(RFLP)对PRRSV进行分类,RFLP方法的引入只是为了区分PRRSV野生型毒株和商品化疫苗毒株(Ingelvac PRRS MLV),RFLP分型在区分不同野生型PRRSV毒株方面能力有限,因此另外开发了一种根据谱系进行分类的方法。但即使谱系提供了更好的区分,两种方法需要结合,才能互相补充并正确鉴定序列。
可以看到,2014年以后,红色所代表的1-7-4占比很大,近期(2020-2021年)1-4-4占比达到峰值,即分类为1-4-4的PRRSV基因组序列的检出率提高了。如果采用根据谱系进行分类的方法,会看到2020-2021年一些非常相近的序列分类为谱系1C序列彼此之间非常相近,在2020年第一次检出时,相似度约99%;在2021年,开始在这一分类中看到更多进化。
从检出的地理分布来看,PRRS 1-4-4病毒株主要分布在明尼苏达州和爱荷华州,最近在俄亥俄州和俄克拉荷马州也有检出,在美国北部和中北部被检测出较多,北卡罗来纳州现在似乎没有检测出这种变异株。
我们也有一个非常常见的问题:它的全基因组是怎样的?我们列出了四种不同毒株及其分类,从ORF2到一部分ORF5的这部分区域,都是来自同一种毒株,ORF6和ORF7也是来自于1-7-4谱系1A毒株,ORF1和ORF5的部分区域是来自于1-4-4谱系1C毒株,因此,我们检测到了重组,另一部分是来自于1-3-4谱系1C,另一部分基因组序列则来自于2-5-2谱系毒株,所以有证据表明和1-7-4毒株的重组,没有证据表明该基因组中存在疫苗毒株序列,目前尚未检测到亲本毒株。
因此,了解全基因组的信息和特征是非常重要。,人们往往很容易将重组归因于疫苗,因为对疫苗株的了解比较多,但这里可以看到,几种野生型毒株导致了重组,但我们没有找到代表重组的亲本毒株。
从田间数据表明,每千头母猪的断奶仔猪损失在不同谱系间也存在差异。与感染谱系1C、1A或1H的猪场相比,感染谱系1C变异株的猪场遭受的损失要大得多(每千头母猪的断奶仔猪损失量是6000头),而其他毒株则是4000头或2000头,差异明显。
随后,Daniel博士总结到:
分类为L1C的PRRSV毒株仍在随着时间的推移而进化,2020年发现了一个独特的聚类,并命名为RFLP 1-4-4 L1C变异株;
L1C变异株已经在爱荷华州和明尼苏达州以及至少其他8个州被更频繁地发现;
在RFLP 1-4-4 L1C变异株中,变异性已经开始随着新簇的形成而出现;
没有证据表明野生型和疫苗株之间存在重组;
需要进行流行病学研究,以更好地了解和描述该毒株的临床相关性、流行病学演变和重要性。
接着,Paul博士分享了新型PRRS1-4-4株的临床表现以及防控措施。
PRRS 1-4-4株的临床症状都是PRRS曾具有的症状表现,没有看到新的特殊的病变或临床症状。但是到目前为止,该病毒株确实会表现出一个明显特征:当疫病在猪群中传播时,很多猪群会表现出类似的疾病进程。这让我们在等待实验室诊断结果之前,能够对该病毒有一定的了解。
1-4-4株对参配母猪每年断奶仔猪数的影响:由于高比例的木乃伊胎,活产率非常低,母猪会恢复正常但有2-4个星期是艰难的。
对从断奶到出栏的群体的临床影响:饮水量大幅减少、猪只拒食、猪只精神状态较差、减重2-4周、死亡率增加。
到目前为止,PRRS 1-4-4株的诊断还比较容易,比如母猪场表现出典型的临床症状、非常低的Ct值(育肥猪)、检测到病毒。
最后,Paul博士提出了对新型PRRSV 1-4-4株的防控管理:1)封闭畜群可以从群体中净化病毒。在进行病毒净化时,尽可能多地让后备母猪进群,且必须有一个场所来放置后备母猪。封闭至少210天或者检测结果显示病毒净化后再引入新的群体,并持续监测。2)保持良好的猪群生物安全,确定风险最大的区域并采取缓解措施。
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