与基因型b相比，基因型a发生严重问题的频率要低得多。为什么这些基因型会发生变化？
受圆环病毒影响的动物
当研究欧洲、亚洲、北美等地猪圆环病毒病的大规模暴发时，发现在所有分析这些健康问题的国家，从2001年到2004年左右，基因型a向基因型b的流行率发生了非常明显的变化。基因型a的严重问题发生的频率远低于基因型b。而显而易见的问题是，为什么这些基因型的频率会发生变化？我们说的是一个没有疫苗引起的免疫压力的时期。我们目前正面临另一个变化，最常见的基因型已从b型转变为d型。为什么会发生这些流行率变化？有人猜测疫苗接种可能影响了这一变化，基于疫苗覆盖率对b型病毒比d型疫苗更有效的观点。但这仍然只是猜测，特别是如果我们记得今天所有的商业疫苗都是基于PCV-2a的话。
已经证明的是，基于PCV2-a的疫苗可以对其他PCV-2基因型提供保护。
到现在为止，已经识别出多少种PCV-2基因型？
最近，我们与意大利帕多瓦大学的Giovanni Franzo博士合作，决定根据基因分型标准创建一个比2008年最初使用的更现代的基因型重演。我们考虑到基因型中存在一定数量的序列。在这个过程中，我们能够建立8个基因型（a、b、c、d、e、f、g、h），尽管在所列的基因型中，有些基因型的代表性较差。
总之，丹麦回顾性地描述了PCV-2c在研究从PCV-2a到PCV-2b患病率的变化时，与PMWS临床问题的发生有关。PCV-2c随后在巴西和中国的一些野猪身上发现。在墨西哥和美国发现了PCV-2e，在中国发现了PCV-2f。我们今天所能说的是，最常流通的基因型是d，其次是b和a。这并不意味着其他基因型不流通，但它们与其他三种基因型的代表性和地域分布并不相同。
PCV-2重组现象如何影响疫苗效力？
的确，在圆环病毒中会发生重组现象。病毒之间的区域有所变化，不同基因型之间也可能发生变化。这如何影响疫苗的效力？应当指出，疫苗是基于PCV-2所含的唯一衣壳蛋白制成的，这是最简单的已知病毒之一。如果我们考虑基因型b和d之间的假想重组会影响整个部分，那么疫苗保护不会有任何问题。如果重组仅影响基因组的一部分，但是重组不是随机发生，而是发生在特定点，这可能是一个问题。由于这些原因，并且鉴于尚未进行具体的研究，目前，重组不被认为是足以影响当前疫苗保护能力的足够大的变异来源。在疫苗接种PCV-2的同时被诊断为临床圆环病毒相关疾病的农场的零星病例与重组病毒的存在无关。
将来不同的PCV-2基因型的频率会改变吗？
这是我们目前尚不知道的事情，但它可能像以前一样发生。有人说这和疫苗接种的影响有关，但是我们还不知道。实际上，今天我们仍然不知道为什么基因型b“更成功”导致频率从a变为b。
关于基因型重要性的兴趣和讨论可能由于这些零星病例而增加，在接种了PCV-2疫苗的农场观察到临床猪圆环病毒病。当基因分型时，这些农场大多数都有PCV-2d基因型。许多专家质疑这是由于基因型逃避了疫苗的作用，还是因为它具有更高的致病性，但我认为这一发现只反映了这样一个事实：PCV-2d是目前农场上最常见的基因型。事实上，基于猪圆环炎临床诊断的研究已经开展，研究了存在哪些基因型，发现最常分离的三个基因型是a、b和d。此外，当发现基因型d的频率越来越高时，当有人质疑目前的疫苗是否能保护这种基因型时，我们进行了实验性感染，结果是疫苗以与a和b相同的方式覆盖了这种基因型。
