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据中国农业大学杨汉春教授介绍，蓝耳病毒在流行数年之后，其致病力和毒力仍未明显降低，我国以北美洲型（基因2型）毒株为主。
蓝耳病毒的Nsp2基因最容易发生突变。“最近2年我们发现，Nsp2基因缺失毒株越来越多，22、25、30、36个氨基酸缺失的毒株都有，而我们自己分离得到了18个氨基酸缺失株。但基因缺失又不是简单的缺失，还能与其他毒株重组，近来还发现了疫苗毒与野毒株的重组，因而所谓的基因缺失株没有意义”。杨汉春说，现在猪场暴发蓝耳病时，都没办法确定是由野毒感染还是疫苗免疫引起的。
灭活苗无效，活疫苗仍是防控首选
目前，对蓝耳疫苗的争议最大的莫过于免疫之后效果的问题，灭活疫苗的免疫效果在推行数年之后，饱受专家质疑。专家建议，在蓝耳疫苗的选择上，仍应该使用活疫苗，应该选择安全性较好的疫苗。
“猪蓝耳灭活疫苗已几乎无效，蓝耳灭活疫苗强制免疫应该取消，我曾就此向农业部提过建议。”杨汉春说。对此，农业部种猪质量监督测试中心（广州）樊福好博士与广西大学刘芳教授都深表认同。
杨汉春还表示，蓝耳病的防控仍然需要使用活疫苗，在活疫苗的安全性存在疑问的情况下，不能进行强制性免疫，而且应该选择安全性好的活疫苗，并根据猪场情况制定个性化免疫程序。
现状三，抗体基本无效
抗体依赖性增强是蓝耳病毒的主要特性之一，在猪只蓝耳抗体水平较低时，并不能抵抗蓝耳病毒感染，反而会促进蓝耳病毒增殖。
“欧洲正在寻求一种通过基因工程表达的蛋白疫苗来控制蓝耳病，注射疫苗后，可以检测到抗体，但进行攻毒实验时，猪群还是发病了。”杨汉春说，“对蓝耳抗体的研究，现在的结论是：蓝耳抗体基本上没用，有用也是抗体依赖性增强。”
樊福好则认为，目前蓝耳抗体还是有一定的作用，作用只是时间的问题。
防控建议，不频繁更换疫苗，不盲目引种。
蓝耳病毒的重组变异是蓝耳防控的难点，专家们一致认为，猪场频繁更换蓝耳疫苗、减毒活疫苗过度免疫是导致目前蓝耳病毒变异速度加快的根本原因之一。杨汉春则建议，猪群每年免疫一次蓝耳疫苗就可以，最多免疫两次，稳定之后就要停止使用疫苗。经产且抗体阳性母猪群不免疫，后备母猪可在配种前1-3个月免疫一次。
另外，引种带来的疫病防控难度增加的问题也越来越明显。
“我曾经碰到一个猪场，抗原检测发现存在多个蓝耳毒株，究其原因，就是从5个猪场多次引种造成的。”杨汉春说。浙江惠丰牧业集团匡宝晓博士建议，对引进种猪隔离一个月以上，再进行驯化。
