在本研究中，用鸟枪宏基因组测序法监测治疗剂量的土霉素对断奶猪粪便中微生物群和耐药基因的动态影响。
将16头断奶仔猪分为2个处理组，即连续21天饲喂标准保育料，或连续7天饲喂添加抗生素的日粮（10 克土霉素/100公斤体重/天），随后连续14天饲喂标准保育料。第0天、第8天和第21天采集粪便进行微生物群和耐药基因分析。
使用土霉素治疗的仔猪比对照组仔猪表现出更丰富和多样的抗生素耐药基因（ARGs）。抗生素的使用显著增加了41个耐药基因的丰度，主要是四环素、β内酰胺和多药耐药类。在抗生素给药7天后观察到菌群组成的变化，与未给药仔猪相比，给药仔猪的大肠杆菌（变形杆菌）和普氏杆菌（拟杆菌）数量增加。这些可能携带抗生素耐药基因的菌群可能在肠道中将抗生素耐药基因转给其它易感细菌。
实验结果将有助于优化猪生产中涉及抗生素使用的治疗方案。
